技术的更迭发展在医学领域是不可或缺的,新技术对病理科而言,意味着可以在更短的时间获得更高的工作效率,为临床医师提供更精确的诊断意见。SureFISH 作为新一代 FISH 技术,又是如何挑战传统,给我们带来便捷呢?
1.以往技术的局限性
以往的 FISH 探针是基于 BAC 即细菌人工染色体技术生产的,因其技术的局限性会产生较高的杂交背景信号,表现为整个细胞核呈模糊的荧光,某种情况下还会产生其他非特异性信号。封闭剂同时也会抑制整体杂交作用从而造成信号抑制。
2.最新技术挑战不可能
而安捷伦推出的 SureFISH 技术,其探针采用电脑设计,然后由安捷伦公司的高保真寡核苷酸文库合成( OLS )技术进行化学合成。那么采用这种方法所设计的探针其优点是什么呢?
其一,高批间一致性 =——无需细胞培养:SureFISH 探针的生产过程确保其具有高批间一致性。该过程中完全避免了 BAC 生物学探针生产过程中可能的批间差异的产生。
其二,高探针特异性——精确靶向目标区域:以电脑模拟方式设计探针可实现真正的设计灵活性。寡核苷酸( oligo ) 探针被设计为具有单碱基对分辨率,可精确靶向任意目标区域。探针的高精密度设计能够实现更高的探针特异性。
其三,高信噪比——无重复 DNA 序列:由于 SureFISH 探针由化学合成的寡核苷酸构成,因此不会出现高杂交背景和非特异性信号等问题。为确保每条 SureFISH 探针真正无重复序列并能够产生清晰信号,每条寡核苷酸都与整个人基因组进行了序列比对以验证靶标特异性。所有非特异性序列都将被剔除。因此,SureFISH 探针既无需进行封闭,也不会出现由封闭剂产生的信号抑制现象。
3.SureFISH 如何颠覆传统?
1.独特的探针设计
与传统的标准设计相比,安捷伦采用的 Micro-gap(微间隙)设计确保了更精准的信号共定位,从而确保探针的高特异性。
2.更短时间、更高效率、更加灵活
不仅如此,SureFISH 采用的杂交液也与传统不同。以往我们用的杂交液是用甲酰胺作用于碱基对间的氢键连接,最大的缺点在于反应时间久,通常需要过夜且有致畸毒性。SureFISH 采用 IQFISH 杂交液技术,其工作原理是以堆积的碱基对为目标,可以在4小时完成全部FISH实验过程,大大缩减了工作时间,提高了工作效率。IQFISH 杂交液采用的是更为安全的碳酸乙烯酯,所以因其无毒的特性,即便没有通风橱也可以进行实验操作,可以说使用起来更为灵活多变。
3.三种类型、八百多种探针 还有自定义探针订制服务
目前安捷伦公司作为唯一一家不使用 BAC 技术生产全面的 DNA FISH 探针的供应商,已经可以提供 800 多种探针,包括各种不同类型的探针:分裂探针、双融合探针和拷贝数探针,同时,安捷伦公司还能提供自定义探针订制服务。在未来,安捷伦公司更会不断挑战自我,不断优化 SureFISH 技术,以更好的服务于病理事业。
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