病理科主要工作内容是通过活体组织检查、脱落和细针穿刺细胞学检查，对病变组织结构及细胞形态识别、分析，并结合临床信息（包括各种检查结果）对疾病做出病理诊断。病理科工作密切接触二甲苯、甲醛等各种有毒、有害试剂，职业危害的风险较大。
职业危害
一、取材
病理科医师将临床科室送检的浸泡在甲醛溶液中的活体组织进行肉眼检查及病理解剖，然后将病变组织切成多个组织块，经过脱水、包埋、切片及染色后进行显微镜观察，最后做出病理诊断。取材时病理科医师需对散发着甲醛气味的标本近距离观察，每天取材时间至少2小时以上，工作量大的单位甚至5小时以上。取材时直接接触甲醛会损害身体健康，而取材结束后空气中仍会长时间弥漫甲醛气味；此外，病理科取材后的剩余标本需在科内保存两周以上。因此，取材完毕及未取材的浸泡标本不断散发出的甲醛，造成工作间空气中甲醛浓度升高。
二、加片染色及封片
在此过程中必须多次使用二甲苯，同时因为需要近距离观察，病理科医师会与二甲苯直接接触。尤其在冰冻检查时，因时间紧迫，病理科医师为了及时反馈诊断，直接对着富含二甲苯液的切片镜检，此时切片与鼻腔的距离不到5 cm，二甲苯吸入量极大。
病理科开展免疫组化检查中常规使用的 DAB（二氨基联苯胺），以及试剂配制过程中经常用的强酸、强碱、丙酮、甲醇、氧化汞等毒害物质，也会对工作人员的健康造成一定危害。
健康状况
一、甲醛
甲醛最主要的刺激毒性反应为流泪、头痛、咳嗽，已被世界卫生组织确定为致癌、致畸物质，是公认的变态反应原，也是潜在的强致突变物之一。长期接触低剂量甲醛可引起慢性呼吸道疾病、月经紊乱、妊娠综合症、新生儿染色体异常，甚至引起鼻腔、口腔、咽喉、皮肤和消化道恶性肿瘤。
二、二甲苯
二甲苯是甲苯的替代品，易挥发，有致癌作用，是病理科必须使用的试剂之一。 虽然现在有环保二甲苯问世，但因其价格昂贵，大部分医院没有使用。 二甲苯有强刺激性，人体对其无任何抗拒反应，吸收后会造成呼吸系统、神经系统、血液系统等损害，对孕妇和儿童损害极大，长期接触可使神经系统功能紊乱，抑制骨髓再生，引起肝肾功能损害，甚至致癌。
据调查，工作场所设置合理、工作环境通风效果良好的病理科，工作人员健康状况与其他科室区别不明显；但工作条件差的病理科，工作人员健康状况存在不同程度的下降，工作时
间越长则健康状况越差，伴随出现白细胞数降低或其他疾病的发生。此外，工作环境中如果存在影响健康的因素，工作人员也会对工作产生心理阴影，对健康担忧。
不同规模医院和工种病理科职业危害存在差异
三级甲等医院出现流泪、头痛、头晕症状的比率高于非三级甲等医院，这可能是因为规模不同的医院工作量、工作强度、工作环境各不相同，三级甲等医院手术量大，病理切片、染色时间长，接触甲醛、二甲苯等化学品的几率大。同时，虽然是三级甲等医院，病理科往往被忽视，大部分病理科还是在老式建筑中，房间设置不合理，工作环境差，面积狭小，通风设备落后，这些都是造成化学危害的原因。
诊断人员出现头晕症状的比例明显高于其它工种。病理科诊断对于诊断医师技术和经验提出了很高的要求，容易导致其心理压力过大，易带来健康的负面影响。其次诊断人员长时间在显微镜下工作，处于弯腰低头或其他强迫性体位，可能是引起头晕症状原因之一。
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