为科学地了解和评价中国大学医学教育发展与创新能力，四川大学中国公立医院社会贡献度研究所根据政府相关机构和各大学公布的相关数据以及学术刊物数据库等，确立了客观反映中国大学医学教育发展与创新能力的各项指标，包括反应学科建设水平及能力的指标，比如医学类博士学位授权一级学科数、国家重点学科数等；反应医学教育创新能力的指标，比如国家重点实验室数，医学相关学科每年在国际杂志发表的文章数等。
通过对100余所中国大学进行客观综合评估，排出2012年中国大学医学教育前50强排行榜。其中排名前10位大学依次为：北京协和医学院、北京大学、复旦大学、四川大学、中山大学、浙江大学、上海交通大学、第四军医大学、中南大学、第二军医大学。
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