病理科成立于1954年，人员来自原第四军医大学和第五军医大学两部分。科室依托第四军医大学基础部病理学教研室，是集医疗、科研、教学于一体的学科。

1978年，科室被批准为硕士学位授权学科。

1986年，被批准为博士学位授权学科。1991年成为基础医学博士后流动站组成学科并生长成为国家“211工程”重点建设学科、“长江学者奖励计划”特聘教授岗位学科。

1993年，被陕西省医学会授予疑难病理会诊中心。

2002年，被评为国家级重点学科。

2005年，被评为肿瘤生物学国家重点实验室。

五十余年来，伴随着医院不断前进的脚步，病理科在各方面也取得了长足的发展。为了适应医疗规模发展的需要，科室曾先后五次扩大实验工作用房面积，特别是2006年搬进新的病房大楼后，科室工作用房面积达到近1000平方米。设备多次更新，由原来几台国产机器发展到现在拥有价值1000多万元的进口设备。

科室拥有长期从事病理诊断和研究的一批技术全面、各具专长的著名专家教授。在现有的44名编制人员中，有教授8名，副教授9名，高级实验师3名，讲师9名。有博士生导师7名，硕士生导师8名。中青年主检医生均具有博士学位，主系列人员80%具有国外长期留学经历，技术系列人员全部具有大学本科以上学历。